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技術分享 | 基因干擾研究工具(上)
吉滿生物
2024-10-08

背景介紹


RNA干擾(RNA interference,RNAi)是指一種分子生物學上由雙鏈RNA誘發(fā)的基因沉默現(xiàn)象,其機制是通過阻礙特定基因的轉(zhuǎn)錄或翻譯來抑制基因表達。


由于RNAi具有高度的序列專一性,可以特異地沉默基因,從而獲得基因功能喪失或基因表達量的降低。


(圖片來源:RNA Therapeutics Institute)


基因干擾有哪些應用呢?


一、基因功能研究


RNAi具有高效特異性抑制基因表達的特點,運用病毒載體介導shRNA干擾可以調(diào)控基因表達,進而研究基因功能


二、信號通路研究


可以運用該技術進行體內(nèi)體外相關信號通路及作用機制的研究


三、構建疾病模型


通過病毒載體介導shRNA干擾可構建轉(zhuǎn)基因抑制小鼠模型


四、基因治療


RNAi被用于基因表達異常升高引起的疾病,如腫瘤和病毒感染等


五、藥物開發(fā)


利用RNAi特異性高效地抑制基因的表達,獲得基因功能抑制表型,進而大規(guī)模地篩選出基因靶點,從而實現(xiàn)短時間內(nèi)藥靶在細胞水平和動物水平的篩選和評定。


常用的基因干擾工具及區(qū)別


常見的干擾工具包括化學合成的雙鏈小干擾RNA(siRNA)、基于載體的短發(fā)夾RNA(shRNA)。



siRNA

shRNA

穩(wěn)定性

低、容易降解,壽命短

作用時效

作用時間較短,一般1周左右

作用時間較長,持續(xù)數(shù)星期甚至更長

脫靶率

導入細胞

的方式

普通轉(zhuǎn)染,對于難轉(zhuǎn)染的細胞轉(zhuǎn)染效率低

導入方式多樣(質(zhì)粒載體/病毒載體)

表達方式

直接化學合成

可由聚合酶Ⅱ型和Ⅲ型啟動子驅(qū)動;可使用誘導表達系統(tǒng);可與報告基因共表達,可視化細胞導入效率

抑制效果

檢測時間

取決于靶蛋白的半衰期


siRNA簡介


siRNA(Small interfering RNA;short interfering RNA;silencing RNA) 是化學合成的小分子,導致基因沉默和序列特異性RNA降解的重要中間媒介,具有特殊的結構特征即5'端磷酸基團和3'端羥基,其兩條鏈的3'端各有兩個堿基的游離,通過與目標mRNA特異性互補結合降解mRNA。



(siRNA結構)


吉滿生物可根據(jù)客戶提供的目的基因信息,設計并合成siRNA,也可以根據(jù)實驗需求,提供多種熒光標記和化學修飾的siRNA。


吉滿生物siRNA合成服務


siRNA合成

普通siRNA

產(chǎn)品質(zhì)量高度穩(wěn)定,凍干粉形式提供

化學修飾siRNA

5’氨基、2’甲氧、5’磷酸化、5’膽固醇、5’生物素

熒光標記siRNA

5’-CY3(紅光)、5’-FAM(綠光)

siRNA陰性對照

陰性對照靶點與哺乳動物基因無同源性

siRNA陽性對照

人源GAPDH、鼠源 MAPK1

siRNA套餐

針對每個靶基因(僅人、小鼠、大鼠編碼基因)設計3條 siRNA(各5nmol),套餐產(chǎn)品還附贈陽性對照和陰性對照各 2.5nmol、轉(zhuǎn)染熒光對照1nmol

通常標準使用條件下即細胞轉(zhuǎn)染效率90%以上,至少1條siRNA的mRNA水平沉默效率可達70%


shRNA簡介


小發(fā)卡RNA(a small hairpin RNA;short hairpin RNA, shRNA)是一段具有緊密發(fā)卡環(huán)的RNA序列,shRNA包括兩個短反向重復序列,可以克隆至shRNA表達載體,后通過質(zhì)粒轉(zhuǎn)染或病毒轉(zhuǎn)導引入細胞,在細胞中經(jīng)酶切形成siRNA,用于沉默靶基因的表達。


(shRNA結構)


shRNA的特點


一、靶向性強


理論上,shRNA能夠?qū)δ繕嘶蜻M行特異性的抑制,而不影響其他基因的表達,在基礎研究和臨床治療中有著廣泛的應用前景。


二、適用范圍廣


shRNA可以用于多種類型的細胞和生物體系中,并且能夠針對多種不同的基因進行沉默。因而使得shRNA成為了研究和治療各種疾病的重要手段。


三、操作簡單


與其他基因敲除技術相比,shRNA的設計、合成和操作相對簡單。通常只需要將shRNA序列克隆到質(zhì)?;虿《据d體中,然后導入到細胞內(nèi)即可實現(xiàn)基因沉默效應。


四、抑制效果持久


shRNA可以在細胞內(nèi)誘導長期的基因沉默效應,其抑制效果可以持續(xù)幾天甚至數(shù)周。這種特點使得shRNA成為了研究和治療需要長期監(jiān)測的疾病的重要工具。


五、可視化的細胞轉(zhuǎn)染效率


通過與熒光蛋白如GFP共表達,可以快速篩選質(zhì)粒轉(zhuǎn)染或病毒感染陽性的目的細胞,大大提高篩選效率。


常見的shRNA干擾載體除了質(zhì)粒表達載體外,還有病毒載體,包括慢病毒載體(LV)、腺病毒載體(AD)、腺相關病毒載體(AAV)等。


吉滿生物shRNA載體構建服務


吉滿生物擁有豐富的載體構建經(jīng)驗,有普通載體和病毒載體可供選擇。吉滿生物可為科研人員提供編碼基因以及非編碼基因(circRNA,lncRNA和microRNA)的干擾服務。


一、服務優(yōu)勢


高效的載體構建策略、優(yōu)惠的產(chǎn)品價格、測序驗證100%正確


二、服務流程

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吉滿生物
2024-10-08

背景介紹


RNA干擾(RNA interference,RNAi)是指一種分子生物學上由雙鏈RNA誘發(fā)的基因沉默現(xiàn)象,其機制是通過阻礙特定基因的轉(zhuǎn)錄或翻譯來抑制基因表達。


由于RNAi具有高度的序列專一性,可以特異地沉默基因,從而獲得基因功能喪失或基因表達量的降低。


(圖片來源:RNA Therapeutics Institute)


基因干擾有哪些應用呢?


一、基因功能研究


RNAi具有高效特異性抑制基因表達的特點,運用病毒載體介導shRNA干擾可以調(diào)控基因表達,進而研究基因功能


二、信號通路研究


可以運用該技術進行體內(nèi)體外相關信號通路及作用機制的研究


三、構建疾病模型


通過病毒載體介導shRNA干擾可構建轉(zhuǎn)基因抑制小鼠模型


四、基因治療


RNAi被用于基因表達異常升高引起的疾病,如腫瘤和病毒感染等


五、藥物開發(fā)


利用RNAi特異性高效地抑制基因的表達,獲得基因功能抑制表型,進而大規(guī)模地篩選出基因靶點,從而實現(xiàn)短時間內(nèi)藥靶在細胞水平和動物水平的篩選和評定。


常用的基因干擾工具及區(qū)別


常見的干擾工具包括化學合成的雙鏈小干擾RNA(siRNA)、基于載體的短發(fā)夾RNA(shRNA)。



siRNA

shRNA

穩(wěn)定性

低、容易降解,壽命短

作用時效

作用時間較短,一般1周左右

作用時間較長,持續(xù)數(shù)星期甚至更長

脫靶率

導入細胞

的方式

普通轉(zhuǎn)染,對于難轉(zhuǎn)染的細胞轉(zhuǎn)染效率低

導入方式多樣(質(zhì)粒載體/病毒載體)

表達方式

直接化學合成

可由聚合酶Ⅱ型和Ⅲ型啟動子驅(qū)動;可使用誘導表達系統(tǒng);可與報告基因共表達,可視化細胞導入效率

抑制效果

檢測時間

取決于靶蛋白的半衰期


siRNA簡介


siRNA(Small interfering RNA;short interfering RNA;silencing RNA) 是化學合成的小分子,導致基因沉默和序列特異性RNA降解的重要中間媒介,具有特殊的結構特征即5'端磷酸基團和3'端羥基,其兩條鏈的3'端各有兩個堿基的游離,通過與目標mRNA特異性互補結合降解mRNA。



(siRNA結構)


吉滿生物可根據(jù)客戶提供的目的基因信息,設計并合成siRNA,也可以根據(jù)實驗需求,提供多種熒光標記和化學修飾的siRNA。


吉滿生物siRNA合成服務


siRNA合成

普通siRNA

產(chǎn)品質(zhì)量高度穩(wěn)定,凍干粉形式提供

化學修飾siRNA

5’氨基、2’甲氧、5’磷酸化、5’膽固醇、5’生物素

熒光標記siRNA

5’-CY3(紅光)、5’-FAM(綠光)

siRNA陰性對照

陰性對照靶點與哺乳動物基因無同源性

siRNA陽性對照

人源GAPDH、鼠源 MAPK1

siRNA套餐

針對每個靶基因(僅人、小鼠、大鼠編碼基因)設計3條 siRNA(各5nmol),套餐產(chǎn)品還附贈陽性對照和陰性對照各 2.5nmol、轉(zhuǎn)染熒光對照1nmol

通常標準使用條件下即細胞轉(zhuǎn)染效率90%以上,至少1條siRNA的mRNA水平沉默效率可達70%


shRNA簡介


小發(fā)卡RNA(a small hairpin RNA;short hairpin RNA, shRNA)是一段具有緊密發(fā)卡環(huán)的RNA序列,shRNA包括兩個短反向重復序列,可以克隆至shRNA表達載體,后通過質(zhì)粒轉(zhuǎn)染或病毒轉(zhuǎn)導引入細胞,在細胞中經(jīng)酶切形成siRNA,用于沉默靶基因的表達。


(shRNA結構)


shRNA的特點


一、靶向性強


理論上,shRNA能夠?qū)δ繕嘶蜻M行特異性的抑制,而不影響其他基因的表達,在基礎研究和臨床治療中有著廣泛的應用前景。


二、適用范圍廣


shRNA可以用于多種類型的細胞和生物體系中,并且能夠針對多種不同的基因進行沉默。因而使得shRNA成為了研究和治療各種疾病的重要手段。


三、操作簡單


與其他基因敲除技術相比,shRNA的設計、合成和操作相對簡單。通常只需要將shRNA序列克隆到質(zhì)粒或病毒載體中,然后導入到細胞內(nèi)即可實現(xiàn)基因沉默效應。


四、抑制效果持久


shRNA可以在細胞內(nèi)誘導長期的基因沉默效應,其抑制效果可以持續(xù)幾天甚至數(shù)周。這種特點使得shRNA成為了研究和治療需要長期監(jiān)測的疾病的重要工具。


五、可視化的細胞轉(zhuǎn)染效率


通過與熒光蛋白如GFP共表達,可以快速篩選質(zhì)粒轉(zhuǎn)染或病毒感染陽性的目的細胞,大大提高篩選效率。


常見的shRNA干擾載體除了質(zhì)粒表達載體外,還有病毒載體,包括慢病毒載體(LV)、腺病毒載體(AD)、腺相關病毒載體(AAV)等。


吉滿生物shRNA載體構建服務


吉滿生物擁有豐富的載體構建經(jīng)驗,有普通載體和病毒載體可供選擇。吉滿生物可為科研人員提供編碼基因以及非編碼基因(circRNA,lncRNA和microRNA)的干擾服務。


一、服務優(yōu)勢


高效的載體構建策略、優(yōu)惠的產(chǎn)品價格、測序驗證100%正確


二、服務流程

Tel: 400-627-9288
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